Protein–RNA interactions for Protein: P13712

MSI1, Chromatin assembly factor 1 subunit p50, yeastyeast

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSI1P13712 YHL044WYHL044W 708 nt2.85□□□□□ -1.95
MSI1P13712 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.85□□□□□ -1.95
MSI1P13712 PEX27YOR193W 1131 nt2.85□□□□□ -1.95
MSI1P13712 KAR4YCL055W 1008 nt2.85□□□□□ -1.95
MSI1P13712 STP1YDR463W 1560 nt2.85□□□□□ -1.95
MSI1P13712 NGG1YDR176W 2109 nt2.84□□□□□ -1.95
MSI1P13712 PSP1YDR505C 2526 nt2.84□□□□□ -1.95
MSI1P13712 URK1YNR012W 1506 nt2.84□□□□□ -1.95
MSI1P13712 YER158W-AYER158W-A 216 nt2.84□□□□□ -1.95
MSI1P13712 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.84□□□□□ -1.95
MSI1P13712 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.84□□□□□ -1.95
MSI1P13712 PUG1YER185W 912 nt2.84□□□□□ -1.95
MSI1P13712 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.84□□□□□ -1.95
MSI1P13712 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.84□□□□□ -1.95
MSI1P13712 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.84□□□□□ -1.95
MSI1P13712 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.84□□□□□ -1.95
MSI1P13712 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.84□□□□□ -1.95
MSI1P13712 BRR6YGL247W 594 nt2.84□□□□□ -1.95
MSI1P13712 UPF3YGR072W 1164 nt2.84□□□□□ -1.95
MSI1P13712 ERP1YAR002C-A 660 nt2.84□□□□□ -1.95
MSI1P13712 YSF3YNL138W-A 258 nt2.84□□□□□ -1.95
MSI1P13712 YNL276CYNL276C 396 nt2.84□□□□□ -1.95
MSI1P13712 YNR062CYNR062C 984 nt2.84□□□□□ -1.95
MSI1P13712 POL30YBR088C 777 nt2.84□□□□□ -1.95
MSI1P13712 ESA1YOR244W 1338 nt2.84□□□□□ -1.96
MSI1P13712 STT4YLR305C 5703 nt2.84□□□□□ -1.96
MSI1P13712 YDR089WYDR089W 2610 nt2.84□□□□□ -1.96
MSI1P13712 SKN7YHR206W 1869 nt2.84□□□□□ -1.96
MSI1P13712 YEL025CYEL025C 3567 nt2.84□□□□□ -1.96
MSI1P13712 YLR108CYLR108C 1458 nt2.84□□□□□ -1.96
MSI1P13712 REC8YPR007C 2043 nt2.83□□□□□ -1.96
MSI1P13712 ERT1YBR239C 1590 nt2.83□□□□□ -1.96
MSI1P13712 YPD1YDL235C 504 nt2.83□□□□□ -1.96
MSI1P13712 YDL242WYDL242W 354 nt2.83□□□□□ -1.96
MSI1P13712 YDR203WYDR203W 318 nt2.83□□□□□ -1.96
MSI1P13712 HTA1YDR225W 399 nt2.83□□□□□ -1.96
MSI1P13712 LIF1YGL090W 1266 nt2.83□□□□□ -1.96
MSI1P13712 YLR050CYLR050C 486 nt2.83□□□□□ -1.96
MSI1P13712 RPL19BYBL027W 570 nt2.83□□□□□ -1.96
MSI1P13712 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.83□□□□□ -1.96
MSI1P13712 ERG29YMR134W 714 nt2.83□□□□□ -1.96
MSI1P13712 OCA2YNL056W 594 nt2.83□□□□□ -1.96
MSI1P13712 AAR2YBL074C 1068 nt2.83□□□□□ -1.96
MSI1P13712 GIS2YNL255C 462 nt2.83□□□□□ -1.96
MSI1P13712 MCA1YOR197W 1299 nt2.83□□□□□ -1.96
MSI1P13712 ARL3YPL051W 597 nt2.83□□□□□ -1.96
MSI1P13712 TOP1YOL006C 2310 nt2.83□□□□□ -1.96
MSI1P13712 XRN1YGL173C 4587 nt2.83□□□□□ -1.96
MSI1P13712 ESC2YDR363W 1371 nt2.83□□□□□ -1.96
MSI1P13712 VPS9YML097C 1356 nt2.83□□□□□ -1.96
MSI1P13712 STE6YKL209C 3873 nt2.83□□□□□ -1.96
MSI1P13712 TAO3YIL129C 7131 nt2.82□□□□□ -1.96
MSI1P13712 YDR042CYDR042C 603 nt2.82□□□□□ -1.96
MSI1P13712 UBC13YDR092W 462 nt2.82□□□□□ -1.96
MSI1P13712 YDR193WYDR193W 399 nt2.82□□□□□ -1.96
MSI1P13712 RMD6YEL072W 696 nt2.82□□□□□ -1.96
MSI1P13712 YGR115CYGR115C 780 nt2.82□□□□□ -1.96
MSI1P13712 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt2.82□□□□□ -1.96
MSI1P13712 DOG2YHR043C 741 nt2.82□□□□□ -1.96
MSI1P13712 YIR040CYIR040C 333 nt2.82□□□□□ -1.96
MSI1P13712 GOT1YMR292W 417 nt2.82□□□□□ -1.96
MSI1P13712 RPS7AYOR096W 573 nt2.82□□□□□ -1.96
MSI1P13712 snR24snR24 89 nt2.82□□□□□ -1.96
MSI1P13712 CST9YLR394W 1449 nt2.82□□□□□ -1.96
MSI1P13712 STU2YLR045C 2667 nt2.82□□□□□ -1.96
MSI1P13712 MIT1YEL007W 2001 nt2.81□□□□□ -1.96
MSI1P13712 POL2YNL262W 6669 nt2.81□□□□□ -1.96
MSI1P13712 PFK26YIL107C 2484 nt2.81□□□□□ -1.96
MSI1P13712 ARG5,6YER069W 2592 nt2.81□□□□□ -1.96
MSI1P13712 GRX2YDR513W 432 nt2.81□□□□□ -1.96
MSI1P13712 YJL114WYJL114W 681 nt2.81□□□□□ -1.96
MSI1P13712 CAP1YKL007W 807 nt2.81□□□□□ -1.96
MSI1P13712 YPT52YKR014C 705 nt2.81□□□□□ -1.96
MSI1P13712 PCD1YLR151C 1023 nt2.81□□□□□ -1.96
MSI1P13712 FAR3YMR052W 615 nt2.81□□□□□ -1.96
MSI1P13712 YOR152CYOR152C 771 nt2.81□□□□□ -1.96
MSI1P13712 ARL1YBR164C 552 nt2.81□□□□□ -1.96
MSI1P13712 POP7YBR167C 423 nt2.81□□□□□ -1.96
MSI1P13712 DPB3YBR278W 606 nt2.81□□□□□ -1.96
MSI1P13712 TRM82YDR165W 1335 nt2.81□□□□□ -1.96
MSI1P13712 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt2.81□□□□□ -1.96
MSI1P13712 YBP2YGL060W 1926 nt2.8□□□□□ -1.96
MSI1P13712 NUR1YDL089W 1455 nt2.8□□□□□ -1.96
MSI1P13712 ITT1YML068W 1395 nt2.8□□□□□ -1.96
MSI1P13712 ERG9YHR190W 1335 nt2.8□□□□□ -1.96
MSI1P13712 OPI6YDL096C 327 nt2.8□□□□□ -1.96
MSI1P13712 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.8□□□□□ -1.96
MSI1P13712 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.8□□□□□ -1.96
MSI1P13712 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.8□□□□□ -1.96
MSI1P13712 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.8□□□□□ -1.96
MSI1P13712 YEL075CYEL075C 369 nt2.8□□□□□ -1.96
MSI1P13712 YFL015CYFL015C 495 nt2.8□□□□□ -1.96
MSI1P13712 GOS1YHL031C 672 nt2.8□□□□□ -1.96
MSI1P13712 YHR054CYHR054C 1065 nt2.8□□□□□ -1.96
MSI1P13712 YLR400WYLR400W 474 nt2.8□□□□□ -1.96
MSI1P13712 RPL13BYMR142C 600 nt2.8□□□□□ -1.96
MSI1P13712 ERG2YMR202W 669 nt2.8□□□□□ -1.96
MSI1P13712 SRL1YOR247W 633 nt2.8□□□□□ -1.96
MSI1P13712 YBR063CYBR063C 1215 nt2.8□□□□□ -1.96
MSI1P13712 CIN8YEL061C 3003 nt2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 55.4 ms