Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYL4P12829 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYL4P12829 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MYL4P12829 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYL4P12829 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYL4P12829 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MYL4P12829 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MYL4P12829 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYL4P12829 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYL4P12829 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYL4P12829 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYL4P12829 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYL4P12829 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYL4P12829 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYL4P12829 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYL4P12829 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYL4P12829 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYL4P12829 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYL4P12829 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYL4P12829 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYL4P12829 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYL4P12829 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYL4P12829 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYL4P12829 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MYL4P12829 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYL4P12829 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYL4P12829 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYL4P12829 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYL4P12829 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYL4P12829 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYL4P12829 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYL4P12829 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYL4P12829 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYL4P12829 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYL4P12829 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYL4P12829 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MYL4P12829 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYL4P12829 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYL4P12829 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYL4P12829 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYL4P12829 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYL4P12829 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYL4P12829 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYL4P12829 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYL4P12829 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYL4P12829 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYL4P12829 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYL4P12829 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYL4P12829 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYL4P12829 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYL4P12829 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYL4P12829 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYL4P12829 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYL4P12829 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYL4P12829 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYL4P12829 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MYL4P12829 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYL4P12829 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MYL4P12829 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYL4P12829 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYL4P12829 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYL4P12829 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MYL4P12829 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MYL4P12829 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYL4P12829 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYL4P12829 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYL4P12829 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYL4P12829 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MYL4P12829 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYL4P12829 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYL4P12829 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYL4P12829 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYL4P12829 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYL4P12829 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYL4P12829 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYL4P12829 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYL4P12829 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MYL4P12829 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYL4P12829 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYL4P12829 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYL4P12829 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MYL4P12829 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYL4P12829 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYL4P12829 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYL4P12829 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYL4P12829 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYL4P12829 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYL4P12829 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYL4P12829 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYL4P12829 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYL4P12829 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYL4P12829 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MYL4P12829 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYL4P12829 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYL4P12829 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYL4P12829 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYL4P12829 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYL4P12829 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYL4P12829 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYL4P12829 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms