Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MS4A1P11836 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms