Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RALAP11233 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RALAP11233 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RALAP11233 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RALAP11233 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RALAP11233 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RALAP11233 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RALAP11233 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RALAP11233 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RALAP11233 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RALAP11233 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RALAP11233 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RALAP11233 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RALAP11233 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RALAP11233 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RALAP11233 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RALAP11233 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RALAP11233 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RALAP11233 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RALAP11233 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RALAP11233 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RALAP11233 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALAP11233 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALAP11233 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALAP11233 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALAP11233 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALAP11233 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALAP11233 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALAP11233 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALAP11233 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALAP11233 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALAP11233 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALAP11233 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALAP11233 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALAP11233 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALAP11233 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALAP11233 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALAP11233 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALAP11233 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALAP11233 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALAP11233 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALAP11233 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RALAP11233 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RALAP11233 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RALAP11233 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RALAP11233 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RALAP11233 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RALAP11233 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RALAP11233 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RALAP11233 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RALAP11233 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RALAP11233 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RALAP11233 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALAP11233 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALAP11233 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALAP11233 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALAP11233 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALAP11233 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALAP11233 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALAP11233 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALAP11233 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALAP11233 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALAP11233 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALAP11233 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALAP11233 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALAP11233 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALAP11233 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALAP11233 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALAP11233 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALAP11233 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALAP11233 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RALAP11233 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RALAP11233 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RALAP11233 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RALAP11233 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RALAP11233 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms