Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
RGPD1P0DJD0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD1P0DJD0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms