Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM6P0DI80 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms