Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNMA6AP0CW24 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms