Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CENPBP07199 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CENPBP07199 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CENPBP07199 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CENPBP07199 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CENPBP07199 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CENPBP07199 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CENPBP07199 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CENPBP07199 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CENPBP07199 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CENPBP07199 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CENPBP07199 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CENPBP07199 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CENPBP07199 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CENPBP07199 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CENPBP07199 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CENPBP07199 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CENPBP07199 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CENPBP07199 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CENPBP07199 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CENPBP07199 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CENPBP07199 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CENPBP07199 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CENPBP07199 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CENPBP07199 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CENPBP07199 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CENPBP07199 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CENPBP07199 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CENPBP07199 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CENPBP07199 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CENPBP07199 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CENPBP07199 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CENPBP07199 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CENPBP07199 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CENPBP07199 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CENPBP07199 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CENPBP07199 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CENPBP07199 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CENPBP07199 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CENPBP07199 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CENPBP07199 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CENPBP07199 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CENPBP07199 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CENPBP07199 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPBP07199 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPBP07199 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPBP07199 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPBP07199 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPBP07199 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPBP07199 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPBP07199 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPBP07199 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPBP07199 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPBP07199 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPBP07199 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPBP07199 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPBP07199 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPBP07199 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPBP07199 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPBP07199 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CENPBP07199 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CENPBP07199 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CENPBP07199 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CENPBP07199 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CENPBP07199 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CENPBP07199 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CENPBP07199 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CENPBP07199 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CENPBP07199 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CENPBP07199 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CENPBP07199 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CENPBP07199 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CENPBP07199 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPBP07199 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPBP07199 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPBP07199 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPBP07199 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPBP07199 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPBP07199 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPBP07199 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPBP07199 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPBP07199 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPBP07199 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPBP07199 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPBP07199 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPBP07199 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPBP07199 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPBP07199 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPBP07199 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPBP07199 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPBP07199 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPBP07199 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPBP07199 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPBP07199 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPBP07199 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPBP07199 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPBP07199 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPBP07199 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPBP07199 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPBP07199 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms