Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DOAP06340 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms