Protein–RNA interactions for Protein: P02778

CXCL10, C-X-C motif chemokine 10, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL10P02778 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CXCL10P02778 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL10P02778 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms