Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTAP01374 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTAP01374 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTAP01374 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTAP01374 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTAP01374 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTAP01374 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTAP01374 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTAP01374 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTAP01374 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTAP01374 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTAP01374 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTAP01374 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTAP01374 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTAP01374 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTAP01374 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTAP01374 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTAP01374 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTAP01374 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTAP01374 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTAP01374 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTAP01374 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTAP01374 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTAP01374 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTAP01374 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTAP01374 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTAP01374 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTAP01374 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LTAP01374 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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