Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRUB2O95900 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms