Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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CLDN9O95484 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN9O95484 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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