Protein–RNA interactions for Protein: O95274

LYPD3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD3O95274 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LYPD3O95274 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms