Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL5O76039 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms