Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MSCO60682 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSCO60682 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSCO60682 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSCO60682 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSCO60682 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MSCO60682 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSCO60682 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSCO60682 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSCO60682 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSCO60682 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSCO60682 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSCO60682 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSCO60682 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSCO60682 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSCO60682 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSCO60682 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSCO60682 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSCO60682 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSCO60682 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSCO60682 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSCO60682 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSCO60682 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MSCO60682 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSCO60682 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MSCO60682 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSCO60682 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSCO60682 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSCO60682 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSCO60682 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MSCO60682 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSCO60682 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSCO60682 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSCO60682 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSCO60682 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSCO60682 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSCO60682 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSCO60682 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSCO60682 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSCO60682 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSCO60682 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSCO60682 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSCO60682 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSCO60682 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MSCO60682 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MSCO60682 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSCO60682 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSCO60682 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSCO60682 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSCO60682 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSCO60682 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSCO60682 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSCO60682 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSCO60682 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MSCO60682 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSCO60682 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSCO60682 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSCO60682 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSCO60682 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSCO60682 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSCO60682 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSCO60682 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSCO60682 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSCO60682 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSCO60682 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSCO60682 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSCO60682 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSCO60682 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSCO60682 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSCO60682 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSCO60682 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSCO60682 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSCO60682 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSCO60682 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSCO60682 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSCO60682 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSCO60682 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSCO60682 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSCO60682 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSCO60682 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSCO60682 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSCO60682 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSCO60682 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSCO60682 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSCO60682 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSCO60682 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSCO60682 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSCO60682 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSCO60682 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSCO60682 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSCO60682 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSCO60682 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MSCO60682 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSCO60682 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSCO60682 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSCO60682 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MSCO60682 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MSCO60682 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MSCO60682 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MSCO60682 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms