Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms