Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYNGR3O43761 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms