Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HTATSF1O43719 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HTATSF1O43719 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HTATSF1O43719 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HTATSF1O43719 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HTATSF1O43719 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HTATSF1O43719 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HTATSF1O43719 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HTATSF1O43719 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HTATSF1O43719 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HTATSF1O43719 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HTATSF1O43719 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HTATSF1O43719 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HTATSF1O43719 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HTATSF1O43719 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HTATSF1O43719 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HTATSF1O43719 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HTATSF1O43719 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HTATSF1O43719 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HTATSF1O43719 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HTATSF1O43719 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HTATSF1O43719 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HTATSF1O43719 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HTATSF1O43719 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HTATSF1O43719 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HTATSF1O43719 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms