Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRODHO43272 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PRODHO43272 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRODHO43272 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PRODHO43272 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRODHO43272 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRODHO43272 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRODHO43272 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRODHO43272 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRODHO43272 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRODHO43272 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRODHO43272 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRODHO43272 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRODHO43272 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRODHO43272 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRODHO43272 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRODHO43272 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRODHO43272 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRODHO43272 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRODHO43272 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRODHO43272 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRODHO43272 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRODHO43272 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRODHO43272 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRODHO43272 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRODHO43272 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRODHO43272 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRODHO43272 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRODHO43272 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRODHO43272 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRODHO43272 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRODHO43272 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRODHO43272 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRODHO43272 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRODHO43272 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRODHO43272 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRODHO43272 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRODHO43272 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRODHO43272 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRODHO43272 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRODHO43272 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRODHO43272 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRODHO43272 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRODHO43272 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRODHO43272 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRODHO43272 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRODHO43272 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRODHO43272 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRODHO43272 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRODHO43272 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRODHO43272 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRODHO43272 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRODHO43272 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRODHO43272 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRODHO43272 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRODHO43272 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRODHO43272 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRODHO43272 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRODHO43272 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRODHO43272 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRODHO43272 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRODHO43272 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRODHO43272 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRODHO43272 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRODHO43272 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRODHO43272 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRODHO43272 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRODHO43272 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRODHO43272 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRODHO43272 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRODHO43272 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRODHO43272 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRODHO43272 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRODHO43272 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRODHO43272 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRODHO43272 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PRODHO43272 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms