Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRXO43186 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRXO43186 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRXO43186 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRXO43186 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRXO43186 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRXO43186 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRXO43186 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRXO43186 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CRXO43186 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRXO43186 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRXO43186 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRXO43186 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CRXO43186 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CRXO43186 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRXO43186 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRXO43186 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRXO43186 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRXO43186 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRXO43186 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRXO43186 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRXO43186 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRXO43186 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRXO43186 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRXO43186 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRXO43186 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRXO43186 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRXO43186 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRXO43186 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRXO43186 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRXO43186 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRXO43186 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRXO43186 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRXO43186 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRXO43186 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRXO43186 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRXO43186 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRXO43186 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRXO43186 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRXO43186 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRXO43186 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRXO43186 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRXO43186 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRXO43186 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRXO43186 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRXO43186 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRXO43186 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRXO43186 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRXO43186 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRXO43186 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRXO43186 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRXO43186 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CRXO43186 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRXO43186 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRXO43186 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRXO43186 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRXO43186 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRXO43186 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRXO43186 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRXO43186 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRXO43186 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRXO43186 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRXO43186 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRXO43186 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRXO43186 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRXO43186 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRXO43186 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRXO43186 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRXO43186 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRXO43186 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRXO43186 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRXO43186 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRXO43186 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRXO43186 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRXO43186 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRXO43186 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRXO43186 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRXO43186 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRXO43186 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRXO43186 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CRXO43186 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRXO43186 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRXO43186 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRXO43186 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRXO43186 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRXO43186 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms