Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UBDO15205 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBDO15205 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBDO15205 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBDO15205 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBDO15205 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBDO15205 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBDO15205 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBDO15205 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBDO15205 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBDO15205 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBDO15205 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBDO15205 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBDO15205 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBDO15205 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBDO15205 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBDO15205 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBDO15205 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UBDO15205 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBDO15205 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBDO15205 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBDO15205 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBDO15205 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBDO15205 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBDO15205 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBDO15205 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBDO15205 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBDO15205 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBDO15205 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBDO15205 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBDO15205 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBDO15205 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBDO15205 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBDO15205 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBDO15205 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBDO15205 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBDO15205 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBDO15205 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBDO15205 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBDO15205 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBDO15205 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBDO15205 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UBDO15205 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBDO15205 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBDO15205 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UBDO15205 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBDO15205 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBDO15205 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBDO15205 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UBDO15205 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBDO15205 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBDO15205 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBDO15205 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBDO15205 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBDO15205 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBDO15205 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBDO15205 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBDO15205 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBDO15205 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBDO15205 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBDO15205 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBDO15205 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBDO15205 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBDO15205 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBDO15205 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBDO15205 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBDO15205 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBDO15205 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBDO15205 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBDO15205 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBDO15205 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBDO15205 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBDO15205 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UBDO15205 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBDO15205 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBDO15205 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBDO15205 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms