Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLGNO14967 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLGNO14967 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLGNO14967 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLGNO14967 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLGNO14967 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLGNO14967 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLGNO14967 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLGNO14967 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLGNO14967 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLGNO14967 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLGNO14967 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLGNO14967 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLGNO14967 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLGNO14967 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLGNO14967 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLGNO14967 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CLGNO14967 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLGNO14967 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLGNO14967 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLGNO14967 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLGNO14967 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLGNO14967 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CLGNO14967 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLGNO14967 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLGNO14967 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLGNO14967 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLGNO14967 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CLGNO14967 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLGNO14967 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLGNO14967 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLGNO14967 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLGNO14967 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLGNO14967 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLGNO14967 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLGNO14967 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLGNO14967 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLGNO14967 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLGNO14967 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLGNO14967 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLGNO14967 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLGNO14967 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLGNO14967 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLGNO14967 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLGNO14967 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLGNO14967 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLGNO14967 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLGNO14967 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLGNO14967 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLGNO14967 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLGNO14967 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CLGNO14967 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLGNO14967 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLGNO14967 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLGNO14967 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLGNO14967 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLGNO14967 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLGNO14967 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLGNO14967 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLGNO14967 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLGNO14967 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLGNO14967 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLGNO14967 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLGNO14967 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLGNO14967 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLGNO14967 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLGNO14967 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLGNO14967 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLGNO14967 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLGNO14967 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLGNO14967 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLGNO14967 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLGNO14967 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLGNO14967 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLGNO14967 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLGNO14967 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLGNO14967 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLGNO14967 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLGNO14967 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLGNO14967 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLGNO14967 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms