Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.57
PTPRTO14522 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PTPRTO14522 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
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