Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms