Protein–RNA interactions for Protein: O00512

BCL9, B-cell CLL/lymphoma 9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL9O00512 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BCL9O00512 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCL9O00512 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCL9O00512 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCL9O00512 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCL9O00512 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCL9O00512 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCL9O00512 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCL9O00512 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCL9O00512 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCL9O00512 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCL9O00512 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCL9O00512 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCL9O00512 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCL9O00512 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
BCL9O00512 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BCL9O00512 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BCL9O00512 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BCL9O00512 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BCL9O00512 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCL9O00512 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCL9O00512 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCL9O00512 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCL9O00512 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCL9O00512 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCL9O00512 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCL9O00512 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCL9O00512 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCL9O00512 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCL9O00512 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCL9O00512 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCL9O00512 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCL9O00512 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCL9O00512 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL9O00512 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL9O00512 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL9O00512 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL9O00512 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL9O00512 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL9O00512 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL9O00512 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL9O00512 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL9O00512 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL9O00512 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL9O00512 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL9O00512 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL9O00512 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL9O00512 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL9O00512 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL9O00512 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL9O00512 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL9O00512 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL9O00512 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL9O00512 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL9O00512 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL9O00512 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL9O00512 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL9O00512 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL9O00512 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL9O00512 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL9O00512 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL9O00512 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL9O00512 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL9O00512 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL9O00512 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL9O00512 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL9O00512 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL9O00512 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL9O00512 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL9O00512 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL9O00512 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL9O00512 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL9O00512 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL9O00512 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL9O00512 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL9O00512 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL9O00512 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL9O00512 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL9O00512 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL9O00512 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL9O00512 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL9O00512 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL9O00512 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL9O00512 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL9O00512 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL9O00512 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL9O00512 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL9O00512 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL9O00512 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
BCL9O00512 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
BCL9O00512 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.58■■■□□ 2
BCL9O00512 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
BCL9O00512 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCL9O00512 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCL9O00512 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BCL9O00512 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BCL9O00512 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
BCL9O00512 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCL9O00512 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCL9O00512 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms