Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATL2C9JE40 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms