Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
B4E1Z4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
B4E1Z4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
B4E1Z4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
B4E1Z4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
B4E1Z4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
B4E1Z4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
B4E1Z4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
B4E1Z4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
B4E1Z4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
B4E1Z4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
B4E1Z4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
B4E1Z4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
B4E1Z4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
B4E1Z4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
B4E1Z4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
B4E1Z4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
B4E1Z4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
B4E1Z4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
B4E1Z4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
B4E1Z4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
B4E1Z4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
B4E1Z4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
B4E1Z4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
B4E1Z4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
B4E1Z4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
B4E1Z4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
B4E1Z4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
B4E1Z4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
B4E1Z4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
B4E1Z4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
B4E1Z4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
B4E1Z4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
B4E1Z4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
B4E1Z4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
B4E1Z4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
B4E1Z4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
B4E1Z4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
B4E1Z4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
B4E1Z4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
B4E1Z4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
B4E1Z4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
B4E1Z4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
B4E1Z4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
B4E1Z4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
B4E1Z4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
B4E1Z4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
B4E1Z4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
B4E1Z4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
B4E1Z4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
B4E1Z4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
B4E1Z4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
B4E1Z4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
B4E1Z4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
B4E1Z4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
B4E1Z4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4E1Z4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4E1Z4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4E1Z4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4E1Z4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4E1Z4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4E1Z4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4E1Z4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4E1Z4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4E1Z4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4E1Z4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4E1Z4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4E1Z4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4E1Z4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4E1Z4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4E1Z4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4E1Z4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4E1Z4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4E1Z4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
B4E1Z4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
B4E1Z4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
B4E1Z4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
B4E1Z4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
B4E1Z4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
B4E1Z4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
B4E1Z4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
B4E1Z4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
B4E1Z4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
B4E1Z4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
B4E1Z4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
B4E1Z4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
B4E1Z4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
B4E1Z4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
B4E1Z4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
B4E1Z4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
B4E1Z4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
B4E1Z4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4E1Z4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4E1Z4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4E1Z4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4E1Z4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4E1Z4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4E1Z4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4E1Z4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4E1Z4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms