Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD3A6NKT7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms