Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
C9orf92A6NGG3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms