Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HELTA6NFD8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HELTA6NFD8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms