Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms