Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR11A4FU01 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR11A4FU01 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR11A4FU01 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR11A4FU01 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR11A4FU01 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR11A4FU01 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR11A4FU01 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR11A4FU01 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR11A4FU01 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR11A4FU01 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR11A4FU01 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR11A4FU01 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR11A4FU01 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR11A4FU01 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR11A4FU01 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR11A4FU01 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR11A4FU01 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR11A4FU01 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms