Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1E9

TRBV7-7, T-cell receptor beta variable 7-7 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms