Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YY99

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YY99 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0J9YY99 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0J9YY99 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms