Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0D9SFI3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms