Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 ECT2-210ENST00000438041 573 ntTSL 45.46□□□□□ -1.547e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 SFPQ-208ENST00000485365 693 ntTSL 24.45□□□□□ -1.75e-15■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 SFPQ-210ENST00000490668 434 ntTSL 24.15□□□□□ -1.755e-15■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 MIS18BP1-205ENST00000469020 880 ntTSL 33.42□□□□□ -1.867e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 SMARCC1-203ENST00000454240 636 ntTSL 327.13■■□□□ 1.932e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.459e-8■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.432e-10■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 MTMR4-206ENST00000582390 1281 ntTSL 523.01■■□□□ 1.272e-10■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 SOX13-209ENST00000534185 723 ntTSL 522.52■■□□□ 1.22e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.122e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ENPP1-204ENST00000513998 3107 ntTSL 521.76■■□□□ 1.072e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 UBA5-204ENST00000464101 570 ntTSL 221.75■■□□□ 1.072e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.062e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.062e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.972e-10■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.952e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.942e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TCEAL4-204ENST00000434216 891 ntTSL 220.88■□□□□ 0.932e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 SOX13-208ENST00000530882 769 ntTSL 320.81■□□□□ 0.922e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.92e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TMEM198-203ENST00000421791 1057 ntTSL 220.28■□□□□ 0.842e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 UBA5-214ENST00000505777 576 ntTSL 419.99■□□□□ 0.792e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.792e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 CHID1-216ENST00000529539 602 ntTSL 219.94■□□□□ 0.789e-8■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 CHID1-218ENST00000531010 408 ntTSL 219.29■□□□□ 0.689e-8■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 POLR1E-203ENST00000442009 1805 ntTSL 219.16■□□□□ 0.662e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.659e-8■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 UQCR11-204ENST00000593029 533 ntTSL 219■□□□□ 0.632e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 SLC35C2-207ENST00000480329 919 ntTSL 218.41■□□□□ 0.542e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.542e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.492e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.489e-8■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.489e-8■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ORMDL1-206ENST00000458355 914 ntTSL 317.98■□□□□ 0.472e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 CHID1-223ENST00000534207 1171 ntTSL 517.64■□□□□ 0.419e-8■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.412e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.412e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TMEM198-204ENST00000451952 505 ntTSL 517.49■□□□□ 0.392e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 SOX13-202ENST00000367203 3525 ntTSL 1 (best)17.32■□□□□ 0.362e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.349e-8■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ABCD3-204ENST00000468860 661 ntTSL 317.13■□□□□ 0.332e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 UBA5-203ENST00000464068 657 ntTSL 517.12■□□□□ 0.332e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.85■□□□□ 0.292e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.282e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.282e-10■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.212e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.214e-9■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.22e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TMEM205-214ENST00000591677 628 ntTSL 216.33■□□□□ 0.22e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PSD4-211ENST00000487574 670 ntTSL 416.26■□□□□ 0.192e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TLE1-204ENST00000418319 936 ntTSL 515.95■□□□□ 0.149e-8■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.099e-8■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TCEAL4-211ENST00000490644 681 ntTSL 315.55■□□□□ 0.082e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 NELFCD-211ENST00000492016 606 ntTSL 215.53■□□□□ 0.082e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.062e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TMEM205-203ENST00000585722 1147 ntTSL 215.45■□□□□ 0.062e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.062e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.062e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PHYKPL-206ENST00000476487 2251 ntTSL 215.42■□□□□ 0.062e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.062e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -02e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.022e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 UBA5-205ENST00000468022 662 ntTSL 514.93□□□□□ -0.022e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.032e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 SLC35C2-212ENST00000493599 2510 ntTSL 214.65□□□□□ -0.062e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 CEP250-204ENST00000422671 2648 ntTSL 514.63□□□□□ -0.074e-9■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.072e-10■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TMEM205-206ENST00000586701 563 ntTSL 514.43□□□□□ -0.12e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.12e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.12e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PHYKPL-207ENST00000481436 2025 ntTSL 214.29□□□□□ -0.122e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TMEM205-209ENST00000588321 1310 ntTSL 514.25□□□□□ -0.132e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 UBE3C-207ENST00000494532 543 ntTSL 214.08□□□□□ -0.162e-16■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 KDM4B-204ENST00000588166 477 ntTSL 514.07□□□□□ -0.162e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.162e-10■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 CDC14B-207ENST00000463547 553 ntTSL 413.66□□□□□ -0.222e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TMEM94-228ENST00000583296 569 ntTSL 213.6□□□□□ -0.237e-16■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.252e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.252e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 IRF9-210ENST00000560542 819 ntTSL 213.11□□□□□ -0.312e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.342e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 MST1L-203ENST00000544155 592 ntTSL 212.84□□□□□ -0.352e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ABCD1-201ENST00000218104 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.362e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.372e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ETFB-204ENST00000594361 2843 nt12.76□□□□□ -0.372e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 CHID1-214ENST00000528534 321 ntTSL 312.76□□□□□ -0.379e-8■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PCSK6-205ENST00000558433 543 ntTSL 412.59□□□□□ -0.392e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ABCD1-203ENST00000443684 668 ntTSL 312.46□□□□□ -0.412e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TCEAL4-205ENST00000459722 779 ntTSL 312.01□□□□□ -0.492e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TMEM205-204ENST00000586218 593 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.492e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.52e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TMEM94-227ENST00000583071 581 ntTSL 311.91□□□□□ -0.57e-16■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 CHKA-203ENST00000525155 1201 ntTSL 511.77□□□□□ -0.539e-8■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TBCK-204ENST00000394708 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.533e-21■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 AC074091.1-201ENST00000505973 1741 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.552e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PSD4-208ENST00000465592 548 ntTSL 411.58□□□□□ -0.562e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 POLR1E-201ENST00000377792 2229 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.572e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PCSK6-212ENST00000560785 507 ntTSL 411.38□□□□□ -0.592e-6■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 TMEM205-213ENST00000590788 393 ntTSL 311.36□□□□□ -0.592e-6■□□□□ 9.2
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