Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q6

TNFRSF11A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF11AQ9Y6Q6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms