Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MAD1L1Q9Y6D9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAD1L1Q9Y6D9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms