Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FARP1Q9Y4F1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FARP1Q9Y4F1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms