Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y467

SALL2, Sal-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL2Q9Y467 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL2Q9Y467 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms