Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms