Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED5Q9Y3A6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED5Q9Y3A6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms