Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOD1Q9Y239 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms