Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHMP2BQ9UQN3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2BQ9UQN3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms