Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ZNF608Q9ULD9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
ZNF608Q9ULD9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms