Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA2Q9UL42 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms