Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMFRQ9UKV5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMFRQ9UKV5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms