Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
CHIC2Q9UKJ5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHIC2Q9UKJ5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms