Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCP2D1Q9UJQ7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCP2D1Q9UJQ7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCP2D1Q9UJQ7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCP2D1Q9UJQ7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2D1Q9UJQ7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2D1Q9UJQ7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2D1Q9UJQ7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2D1Q9UJQ7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2D1Q9UJQ7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2D1Q9UJQ7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2D1Q9UJQ7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2D1Q9UJQ7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2D1Q9UJQ7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2D1Q9UJQ7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2D1Q9UJQ7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2D1Q9UJQ7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2D1Q9UJQ7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2D1Q9UJQ7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2D1Q9UJQ7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2D1Q9UJQ7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms